وتوفى الامام سنة 94 أو 95 ه أثناء خلافة الوليد ، وكان هشام إذ ذاك لا يزال شابا ، وعمر الأمام زين العابدين سبعا وخمسين سنة ، فلا يبعد أنه مات ميتة طبيعية . ودفن إلى جانب عمه الحسن في البقيع . وقد قضى سنتين من عمره في زمن على ، وعشرا مع الحسن ، وعشرا مع الحسين ، وخمسا وثلاثين سنة إماما .